战国时期的医疗资源分配主要依赖于各忍者家族的内部体系，由于战乱频繁且缺乏统一的忍村制度，医疗资源往往集中在实力较强的家族手中。千手一族作为拥有仙人之体的族群，其医疗忍术的发展较为先进，尤其是千手柱间和纲手所代表的医疗能力，成为家族内部重要的战略资源。这种资源通常优先分配给族内高层和核心战力，以确保家族在战争中的生存优势。其他中小型家族则依赖传统的草药治疗或简单的医疗忍术，资源分配更加有限且不稳定。
医疗资源的获取与分配也受到家族间敌对关系的严重影响。在战国时期，忍者家族之间互相敌对，医疗资源很少通过贸易或合作共享，而是通过战争掠夺或秘密交易获得。千手一族和宇智波一族作为敌对家族，医疗资源完全独立运作，甚至会出现针对敌方医疗体系的破坏行动。这种封闭性导致医疗技术发展缓慢，且资源分配极度不均衡，弱势家族往往因缺乏医疗支持而在战争中处于更不利的地位。
医疗忍者在战国时期的地位特殊，他们既是资源的使用者，也是分配的关键决策者之一。由于医疗忍术需要极高的查克拉控制能力，这类忍者通常由家族重点培养，并在资源分配中享有较高优先级。纲手作为千手一族的后裔，不仅掌握了高级医疗忍术，还开发了百豪之术等创新技术，这些资源会被严格控制在家族核心圈层内。医疗忍者的稀缺性也使得他们的行动往往伴随严密的保护，以避免被敌方针对或俘虏。
这一转变使得医疗技术得以更广泛地应用，例如木叶医院的出现为普通忍者提供了基础医疗保障。在战国时期的大部分时间里，医疗资源始终是家族实力的象征，其分配逻辑始终围绕战争需求展开，而非普惠性的医疗福利。这种历史背景也为后续忍村时代的医疗体系发展奠定了基础。
