第六章西征巴蜀是游戏进程中的重要转折点，队伍将面临更高强度的战斗和更复杂的迷宫探索。开局阶段需优先调整队伍配置，张飞作为主将不可或缺，军师庞统的加入带来战术多样性，另需从编成所选三人补充战力，黄忠和魏延是优选对象。队伍成型后立即前往水镜先生宅与司马徽对话获取酒，这是触发后续剧情的关键道具。
襄阳城左上角屋内的酒鬼需要交付酒才能继续剧情，选择确认后前往西面森林击败廖化并使其加入。廖化作为早期可用武将，能有效填补队伍战力空缺。返回襄阳与酒鬼对话后庞统正式入队，队伍核心架构已初步完善。与刘备对话后诸葛亮、关羽、赵云暂时离队，需在编成所重新调整阵容。
西蜀地图的获取是推进主线的必要条件。队伍需前往襄阳西面山洞探索，洞内路径复杂但宝物丰富，第二层存在机关需按特定路线行进：北走第三个路口后东行三个路口，再北走五个路口，西行三个路口，最后北走四个路口向东即可到达第三层入口。第三层布满八卦符号会扰乱方向感，耐心摸索可取得银仙石和血书。
与孟达对话后其加入队伍，返回新野城与刘备交谈触发渡口剧情。法正在西南渡口等待，对话后成为队友并开启乘船前往益州的路线。进入涪水城与刘璋会面后，东北村子的李恢会要求查看西蜀地图，务必确保道具栏携带该物品。后续需前往北面景帝墓取得血书，这是证明身份的重要任务物品。
葭萌关战役是本章首个难点，马超、马岱的组合具有高强度攻击力。建议战前储备足够野营帐和银仙丹，利用庞统的计谋控制战场节奏。击败二人后通过对话可使其加入，大幅提升队伍输出能力。阳平关的杨任部队与南郑关的杨昂部队构成连续战斗考验，需合理分配资源消耗。
汉中城的张鲁战役前，务必与南郑关中间屋子的王平对话获取情报。战后出城遭遇杨怀触发剧情，返回涪水城将面临张任部队的伏击。庞统在落凤坡战役中注定阵亡，这是无法回避的剧情杀，但战后诸葛亮团队会重新归队。此阶段需注意装备更替，为后续巴城战役做好充分准备。
